故事背景設定在太平洋戰爭中后期，日本海軍在中途島海戰中被美海軍大敗；第一機動艦隊4艘航母被擊沉；聯合艦隊司令長官山本五十六大將戰死，太平洋上各島嶼的日軍守備部隊先后覆沒，日海軍處于嚴重不利的形勢。
昭和19年（公元1944年）的春天，特別少年兵部隊的神尾懷著對大和號的憧憬，登上了超弩級戰列艦“大和”號的甲板，當時的大和號是日本國民和軍人的希望與象征。神尾忍受了艦上嚴酷的訓練，然后迎來了他的第一次實戰——萊特灣大海戰。
在這次海戰中，聯合艦隊事實上已經土崩瓦解。當殘酷的戰局放在面前，大和號和它的船員們懷著守護國土的決心，起錨迎來它的最后一次悲壯決戰。所有的人都很清楚：迎接他們的將是殺氣騰騰的美軍大批艦載機群.............
